В самом конце 1993 года случился пожар и здание синагоги сгорело дотла. Но свитки Торы уцелели в этом пожаре — это чудо прихожане восприняли как благословение. Рядом с пепелищем построили временное здание синагоги, небольшое, но уютное, с красивыми витражами. Сегодня в нем располагается духовный центр московской общины бухарских евреев.

Сегодня на месте сгоревшей синагоги построено современное семиэтажное здание Московского Еврейского Общинного Центра. Проект здания создал главный архитектор Тель-Авива Исраэль Годович. Фасад отделан иерусалимским камнем. Сама синагога Бейс Менахем (названная в честь Седьмого Любавичского Ребе Менахема-Мендла Шнеерсона) располагается на втором этаже центра. Её здание, как и предписывает традиция, ориентировано на Иерусалим.