Появился этот доходный дом ещё в начале XX века, по желанию страстного поклонника искусства Перцова. Перцов хотел выстроить дом, в котором были бы расположены жилые квартиры, а также мастерские для художников. Ещё инженер хотел, чтобы само здание являлось произведением искусства, внешний вид которого говорил бы о самобытности русской культуры. Перцов оформил участок и дом на свою жену Зинаиду Алексеевну, так что здание известно именно по её имени.

Здание имеет множество сложных элементов, но все они органично сочетаются друг с другом. Такое единение причудливых форм в пластичное целое характерно для стиля модерн. Эскизы для дома, кстати, готовил не кто иной, как Сергей Малютин, создатель известной на весь мир русской куклы матрёшки.

В оформлении фасада и остальных частей дома использовались традиционные русские мотивы — балконы-теремки, волшебные животные и растения, некоторые традиционные узоры.

В 1908 — 1910 годах в здании располагалось кабаре «Летучая мышь», посетители которого могли видеть Немировича-Данченко, Книппер-Чехову, Качалова и самого Станиславского в различных традиционных для подобного заведения амплуа — они устраивали цирковые представления, фокусы, розыгрыши и просили своих зрителей ни в коем случае не обижаться.

С середины 1970-х дом Перцовой используется Главным управлением по обслуживанию дипломатического корпуса при МИД России. Здание переоборудовали под офисы, а в подвальных помещениях организовали столовую.